Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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