Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms