Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms