Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms