Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
CtdsplP58465 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms