Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcanP55066 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcanP55066 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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