Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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