Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf19aP50636 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf19aP50636 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf19aP50636 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf19aP50636 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms