Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept1P42209 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept1P42209 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept1P42209 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms