Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms