Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms