Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms