Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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