Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a2P20490 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms