Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms