Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18530 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18530 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms