Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18529 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18529 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18529 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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