Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms