Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms