Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cxcl2P10889 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms