Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms