Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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