Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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DffaO54786 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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DffaO54786 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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