Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms