Protein–RNA interactions for Protein: O35601

Fyb1, FYN-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyb1O35601 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fyb1O35601 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms