Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms