Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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