Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms