Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms