Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm21818J3KMS6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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