Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms