Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Herc1E9PZP8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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