Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms