Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms