Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms