Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms