Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6880A3KG45 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms