Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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