Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calcoco2A2A6M5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms