Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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