Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5538W4VSP6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5538W4VSP6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms