Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm26992S4R1A3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms