Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria3Q9Z2W9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria3Q9Z2W9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms