Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn8Q9Z260 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms