Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ap3b1Q9Z1T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms