Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dctn3Q9Z0Y1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dctn3Q9Z0Y1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms