Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xpr1Q9Z0U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xpr1Q9Z0U0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xpr1Q9Z0U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms