Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip2Q9Z0H8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip2Q9Z0H8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms