Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms