Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms